В феврале 1963 года Президиум Верховного Совета РСФСР вынес постановление о присвоении посёлку Учалы
городского статуса. Город образован 1 февраля 1963 года слиянием рабочих поселков Малые Учалы и Новые Учалы. Город Учалы является административным центром Учалинского района Республики Башкортостан, с 1 января 2006 года город имеет статус городского поселения в составе муниципального района Учалинский район.
История названия города. • Город назван по имени близлежащих озёр: Большое Учалы и Малое Учалы. Про происхождение названия озера существует несколько версий. • Башкирское Учалы переводится как «Ус алды» — отомстил. По легенде, в этом месте в конце 14-го века Тамерлан, воюя с золотоордынским ханом Тохтамышем, вырезал кочевья южноуральских башкир, поддержавших Тохтамыша. • Башкирские геологи полагают, что название Учалы произошло от слова «Юшалы», а «юша» — это обобщённое башкирское название цветной гаммы горных песчано-глинистых отложений. Эти разноцветные глинисто-охристые породы в старину использовались для выработки красок. Но вполне возможно, что название «Юшалы» — это видо¬изменённое звучание «юша» (яшма, яшмовая). Вполне исторически обоснованно: через Учалинский район проходит яшмовый пояс Урала. • Также в качестве источника названия озера приводится татарское слово ачулы — «гневный».